6月18日，交通運輸部印發《關于進一步強化交通運輸疫情防控措施堅決防止疫情反彈的通知》（簡稱《通知》），要求緊密結合疫情防控新形勢，因時因勢調整北京交通運輸疫情防控措施，加強環京“護城河”地區交通運輸疫情聯防聯控，加強物資運輸保障和防疫管理，嚴密防范疫情通過交通運輸環節傳播蔓延。
北京公交地鐵控制客流 省際客運班線全部停運
《通知》要求北京從嚴執行防疫措施，嚴格出京旅客信息核查，強化從業人員防疫管理、做好城市交通保障，實施特殊時段進出京客票免費退票，及時發布進出京客運停運信息。
北京市交通委員會副主任容軍在6月18日下午召開的北京市新冠肺炎疫情防控工作新聞發布會上表示，6月18日起，北京公共交通運營企業按照地面公交滿載率不超過90%、軌道交通滿載率不超過80%的標準控制客流，通過優化運營組織調度、合理投入運力、啟動疏導限流措施等，確保運營秩序。
北京公共交通行業防控措施進一步提高工作標準，對途經高風險重點區域的公交線路，落實場站設施每小時消毒1次、車輛內部每趟次消毒1次并持續通風；對于新發地市場、玉泉東市場、天陶紅蓮菜市場等重點地區周邊的軌道交通車站，進一步強化防控措施。
北京市發生聚集性疫情后，遼寧、河北、四川、浙江等省份出現關聯病例。《通知》要求，加強環京“護城河”地區交通運輸疫情聯防聯控，繼續暫停出租汽車、順風車進出京業務。6月19日起，北京所有省際客運站運營的省際客運班線全部停運，已購買車票的旅客可全額退票。進出京省際旅游包車客運業務繼續暫停。此前已恢復的31條跨京冀公交線路，已再次臨時停駛2條（城際灤平線、838路），預計近日還將有部分線路根據河北方面要求臨時停駛。
6月18日，北京首都國際機場、北京大興國際機場同步實施出京旅客健康碼和核酸檢測證明查驗工作，“北京健康寶”狀態為“未見異常”、體溫監測未見異常的旅客可進入航站樓，出京旅客須持有7日內核酸檢測證明。大興機場城市航站樓草橋站的值機、托運等業務暫停運行。
進出京道路貨運封閉式管理
《通知》提出，北京市交通委員會要積極會同相關部門按照“封閉式管理、人員不接觸、車輛嚴消毒”的總體要求，做好進出京道路貨運疫情防控工作，避免交叉感染。各地交通運輸主管部門要加強與相關部門的溝通對接，對短期向北京地區運送物資的司機、裝卸工（包括郵政快遞車輛司機、裝卸工）等從業人員，在體溫監測正常和封閉式管理的前提下，原則上不需采取隔離14天的措施。
做好北京地區生活必需品等重點物資運輸保障。各地交通運輸主管部門要在當地疫情防控領導機構領導下，重點圍繞保障北京地區生活必需品、疫情防控物資運輸需求，統籌做好物資中轉調運和保通保暢工作，指導道路貨運企業加強運力組織和司機調配，避免出現因運力不足、人員短缺影響北京地區生活必需品和疫情防控物資供應。
據了解，北京高速公路管理部門將堅持高標準執行收費站區和服務區的防控措施，嚴格落實公共區域消毒、在崗人員佩戴口罩、體溫監測等措施，嚴格執行CPC卡發放、回收、調撥、入庫等各環節消毒工作；對疫情防控應急物資、人員車輛，設立專用通道，管理人員一線保障、專人引導，嚴格落實“三不一優先”原則。
《通知》中還明確，要嚴格做好公路水路口岸出入境運輸疫情防控工作，以最嚴措施組織做好“點對點、一站式”入境人員接運工作；全面落實運輸場站、交通運輸工具、公路服務區、公路水運工程建設等領域常態化防控工作各項要求，進一步完善突發公共衛生事件交通運輸應急預案，確保一旦出現散發病例或發生局部疫情后的防控和應急處置工作及時有效。
